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好氧反硝化菌種的復蘇培育剖析

返回列表 來源:未知 發布日期:2019-08-06 10:24【

藤黃球菌( Micrococcus luteus) 所分泌的復蘇促進因子( resuscitation-promoting factor,Rpf) 的發 現被認為是復蘇培養 VBNC 狀態菌最重要的突 破。Rpf 在皮摩爾濃度下即可使自身處于 VBNC 狀態的細胞復活,并使可培養數量增長至 100 倍 以上,且可促進細胞的生長。研究發現制藥廢 水中對 Rpf 敏感的 VBNC 優勢菌群主要有革蘭氏 陽 性 ( G+ ) 菌 如 Microbacterium、Gordonia 和 Leucobacter 屬 等,及 革 蘭 氏 陰 性 ( G- ) 菌 如 Candidimonas、Xanthobacter 和 Aminobacter 屬 等。



1 材料與方法

1. 1 實驗材料

高氨氮廢水取自浙江省金華市某工業污水處 理廠,其 COD 為 500 mg /L,NH+ 4-N 為 420 mg /L, NO- 2-N 未檢出,NO- 3-N 為 10 mg /L,pH 值為 7. 2。 1. 2 儀器 紫外分光光度計( UV-7504,上海欣茂儀器有限公司) ; 恒溫培養振蕩器( ZHWY-100C 上海智 誠儀 器 分 析 制 造 公 司) ; 臺 式 離 心 機 ( 5417R, Eppendorf) ; 恒溫恒濕培養箱( HWS-350,寧波海 曙塞富實驗儀器廠) ; 電子天平( JY3002,上海精密科學儀器有限公司 ) ; 移 液 槍 ( P500, Eppendorf) ; 電熱鼓風干燥箱( DHG-9070A,上海精宏實驗設備有限公司) 。



2 實驗方法

2. 1 Rpf 蛋白純化


將 M. luteus 的 rpf 基因克隆在 Escherichia coli BL21 ( DE3) 中誘導表達,經純化后獲得 Rpf 蛋白。 具體步驟簡述如下: 將 質 粒 轉 化 的 Escherichia coli BL21( DE3) 接種至含有 50 mg /L 相應抗生素的 LB 液體培養基中,37 ℃,120 r/min 培養至對數生長期,然后再接種至 200 mL SOB 培 養基中擴大培養,確認轉化細菌濃度為 OD600 = 0. 6 時,加入 IPTG 誘導劑至終濃度為 1 mmol /L, 20 ℃,120 r/min 誘導過夜。 離心( 12 000 r/min,10 min) 收集細胞,加入 緩沖液重懸菌體,并超聲破碎使得蛋白釋放出來。 經 Ni 柱吸附,100 mmol /L 的咪銼洗脫液洗脫后, 再利用純化試劑盒對目的蛋白進行純化。提純的 Rpf 蛋白經 0. 22 μL 微孔濾膜過濾后,加甘油至終 濃度為 50%,置于-20 ℃ 保存備用。同時,將 Rpf 蛋白高壓滅活( 121 ℃,20 min) 用于對照組的實 驗研究。



2. 2 Rpf 蛋白對

VBNC 菌的復蘇促進作用 MPN 培養體系中,吸取 1 mL 采自于污水處 理廠的高氨氮廢水加入至 9 mL LB 液體培養基 中,而后依次稀釋,連續設置 10 個稀釋梯度,每一個梯度設立 3 個平行。在各處理組稀釋液均 添加 0. 25% Rpf 蛋 白,對照組各稀釋 液添加 0. 25%無活 性 Rpf 蛋 白 上 清 液,將 樣 品 放 置 在 30 ℃ ,120 r/min培養體系中生長。通過測定處理 組與對照組培養液菌體密度( OD600 ) 來反映 Rpf 對菌體生長狀況的影響。同時記錄樣品的濁度以 獲得 MPN 值,利用 MPN 表計算出每個樣品中可 培養細菌的總數。 當細菌總數處于穩定,將處理組與對照組培 養液最大稀釋度分別涂布于固體平板中獲得可培 養細菌。對比兩組涂布平板的菌落差異,僅存在 于處理組的菌株則為對 Rpf 蛋白敏感的 VBNC 菌。將純化后的的菌株擴大培養并收集至 10% 的甘油中,-80 ℃ 保存。每種稀釋度的剩余培養 液則放至-20 ℃保存備用。



3 實驗結果分析

基因經克隆,并在 Escherichia coli BL21 ( DE3) 中誘導表達及系列純化后,獲得 Rpf 重組蛋白。結果如圖 1 所示,由 SDS-PAGE 圖可 知,蛋白洗脫液中含有清晰的目的條帶,重組蛋白 的分子量約為 23 kDa,且雜條帶數量相較于粗體 液明顯減少,說明經 Ni 柱洗脫后得到了純度較高 的 Rpf 蛋白。 本研究中所獲的重組蛋白的分子量相對于 Mukamolova 等從藤黃球菌上清液中分離提取的 Rpf 蛋白( 16~17 kDa) 偏大,其原因為此重組蛋白 未去除 N 端的 6 個 His 標簽。同時,與 Mukamolova 等所獲的重組蛋白分子量( 25 kDa) 相當。每隔 24 h 記錄 MPN 培養體系中處理組和對 照組在 600 nm 處的光密度值。當數值趨于穩定 后,讀取 MPN 值。在培養體系中,處理組最后 3 個稀釋度分別有 3 個,3 個和 2 個渾濁管,對照組 分別有 3 個,3 個和 1 個渾濁管,透明管意味著其 OD600值接近于 0。在各稀釋度中,處理組的菌體 生長量均大于對照組,尤其是在最后的稀釋度中,這表明 Rpf 可促進細菌的生長。



4 結論

1) 本研究表明高氨氮廢水中存在大量對 Rpf 敏感的 VBNC 細菌,其數量占總菌數的 58. 1%。 并分離純化 4 株 VBNC 菌株,其中 ZYR51 歸屬于 Gordonia 屬,菌 株 CHZYN52、CHZYR61 和 CHZYR63 均歸屬于 Pseudomonas 屬。

2) 本研究表明 Pseudomonas 和 Gordonia 屬可 能為高氨氮廢水中存在的主要 VBNC 功能菌群, 經 Rpf 復蘇后具有較好的好氧反硝化性能。

3) 本研究揭示在高氨氮廢水中,與藤黃球菌 具有較好親緣關系的 Gordonia 屬菌株 ZYR51 的 脫氮性能最強。從而為挖掘高效好氧反硝化菌提 供新的思路。




 

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